一般采用溢流方式过滤的大型鱼缸，都会在水面处开一个溢流口，直接将油膜导入过滤系统中过滤分解。
采用上滤、瀑布等方式过滤的小缸，可以在水面添加一个入水口，直接吸取油膜，动手能力不强的的话，水族店里和淘宝网上有成品，叫除油膜器。但这种除油膜器不建议使用在过滤桶上，因为其可能导致过滤桶内吸入大量空气，干扰水泵正常工作，甚至烧泵。
鱼缸不大，养鱼过多或者是过滤器的功率小，不能完全过滤污物，绿藻生长也会很快。
喂食过多，鱼吃不完饲料，饲料在水中腐烂，水质过度营养化，使水中更快积累氨等物质，经过硝化，会转换成硝酸盐，硝酸盐是水草和水藻的重要肥料，水中含有很多硝酸盐的话，水藻也会狂长。
光照太强，使水中的绿藻不断生长，所以水就会变绿了。现在只能换水，为鱼缸遮阴，鱼缸不能让放在窗边，让太阳直射。如果是鱼缸壁有绿藻，可以养一两条清道夫来吃绿藻。 藻虾，黑壳虾或苹果螺（福寿螺）也可以。
鱼缸里的水会因鱼类的粪便、食物残渣、水草腐叶而受到污染。在人们想象中将水中看得见的悬浮物过滤掉，使水保持清澈透明就已达到目的，其实这仅仅只是过滤的初级功能，我们通常称之为机械过滤。现代的观赏鱼缸过滤应是同时具有机械过滤和生物过滤，有时还需要物理过滤。其中尤为重要的是生物过滤。所谓生物过滤，就是通过附着在滤材上的，将溶解在水中的有害物质分解或转化为无害物质。物理过滤则是利用某些材料特有的吸附功能使水净化。物理过滤只在特殊情况下短时间使用，如为了去除水中的剩余药剂等。