第二池的粪皮和粪渣的数量减少，因此发酵分解的程度较低，由于没有新粪便的进入，粪液处于比较静止状态，这有利于漂浮在粪池中的虫卵继续下沉。第三池：主要起储存粪液的作用。经前二格处理的粪液进入第三池，基本上已经不含寄生虫卵和病原微生物，达到了粪便无害化要求，可以供农田直接施肥。
化粪池清理注意事项：
1.进入化粪池的人须戴防毒面具和防毒服，以及安荃带。安荃带上应绑一根能承受100公斤以上重量的绳子，绳子的另一端应绑在露出化粪池的梯子上。 2.化粪池上须有两三个人随时注意化粪池的情况。如果以下情况不对，请拉上清理化粪池的工作人员。 3.化粪池一般有三个井盖，每个井盖有两个小洞。我们须每半小时或一小时打开每个井盖上的小洞。 4.用钩子打开井盖，用消防水冲洗每个井口约半小时。这可以减少化粪池中的沼气。 5.将长度约5米的竹竿插入化粪池，获得化粪池污垢和污水的深度。 6.如果化粪池的深度超过1.5米，我们须将竹梯或其他比化粪池深1米的梯子放入化粪池。
人工清理是目前为常见的一种化粪池清理方式。需要特殊工具，如胶水吸管、硬鹅毛刷等，并配合化学清洗剂使用。可以将化粪池内的垃圾等物质人工取出，再用硫酸、酸碱等化学药剂清洗，以达到除臭、清洁化粪池的目的。
化学清理是一种相对较新的清理方式，它使用化学物质对化粪池进行清洗，同时能够消除异味、除垢效果好。化学清洗是通过环保清理产品，如油垢清洁剂、活性污泥等进行清理，以达到清洁、除臭等目的。这种方法清理效果好，速度快，但是会影响环境健康，需要注意防护措施，防止化学物质对人体造成损害。