在国际上存在一段时间的争论：到底医学实验室是采用通用的检测实验室认可要求ISO/IEC 17025:2005还是应该使用专用的ISO 15189:2007。应为即使是作为通用的检测实验室认可要求的ISO/IEC 17025也是在其特殊领域的应用说明文件中列出了医学实验室的特殊要求。
标准方法的使用 对于需要使用非标准方法的进行检测时，一定要书面征求委托方的同意。技术负责人应与委托人签定“协议方法”的执行契约。这些“协议方法”的制定应尽量引用一些公认的标准： a 其他企业公开的标准或方法 b 国际组织标准 c 技术组织推荐的方法人 d 科学杂志推荐的方法
ISO17025实验室检测方法要求是: ISO17025实验室检测方法第二是将执行的技术依据为国家法律和法规所承认的现行有效的国家标准和行业标准及实验室相应的检测标准方法（或规程）做为作业指导书。作业指导书应方便工作人员使用。具体执行《质量体系文件控制程序》。
1999年12月3日我国实验室认可制度与亚太实验室合作组织（APLAC）的主要成员中的12个认可机构签署了互认协议。2000年11月我国实验室认可体系又与欧洲认可合作组织（EA）和南非、巴西的实验室认可机构签署了互认协议。至此我国已与27个国家和地区中的37个国家实验室认可机构和经济贸易地区的实验室认可机构达成了互认协议。我国认可的实验室以及认可实验室出具的检验/校准数据开始得到国际社会的承认，这意味着在消除国际贸易中的技术壁垒方面，我国质量认证制度又向国际化的要求迈出了一大步。