氨基酸的种类和含量
燕窝中的氨基酸种类丰富，富含苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、酪氨酸和精氨酸等。燕窝中的水解氨基酸含量达42.272%，且必需氨基酸含量占氨基酸总量的42%；同时，呈鲜味特征的氨基酸（天门冬氨酸和谷氨酸）和呈芳香味特征的氨基酸（酪氨酸和苯丙氨酸）含量较高，表明燕窝的味道鲜美。食物营养价值的优劣主要取决于所含氨基酸的种类、数量和比例。联合国粮农组织和世界卫生组织提出了食品中必需氨基酸参考模式谱，规定了人体必需氨基酸占总氨基酸的质量比以及必需氨基酸与非必需氨基酸的质量比分别为40%和60%。
蛋白质
燕窝中的蛋白质含量较高，但与其品种关系紧密。试验选用的马来西亚金丝燕燕窝，其含量达50.26%。
唾液酸
唾液酸又称燕窝酸，是燕窝主要的生物活性成分，在燕窝中主要以N-乙酰神经氨酸形式存在。据报道，一般燕窝的唾液酸含量可达7%以上，这也是初步鉴定真假燕窝的手段。
海参触手的形状是分目的重要依据，枝形触手见于枝手目海参；盾形触手见于盾手目和平足目海参，羽形触手见于无足目海参，指形触手见于指手目海参。海参触手的数目常为10个、15个、20个、25个或30个，一般均为5的倍数，但也有12个的，海参的体壁柔韧，富于结缔组织，厚薄随种类而异，大凡体壁厚的种类均可食用，体壁薄的种类则失去食用价值。
海参的神经系统和血系统基本上按水管系统排列。但是盾手目海参的血管系统特别发达，有非常复杂的血管丛，称为异网（retemirabile），和背血窦相连。
海参的体壁含有较厚的结缔组织，食用部分主要也是体壁部分。肌肉系统只是体壁上的5条或5对纵肌和环肌，才是真正的肌肉。